Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3EQ9NVU0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR3EQ9NVU0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms