Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIC8BQ9NVN3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIC8BQ9NVN3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms