Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPTLC3Q9NUV7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms