Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATG3Q9NT62 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ATG3Q9NT62 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATG3Q9NT62 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms