Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT82Q9NSB4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT82Q9NSB4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms