Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS45Q9NRW7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS45Q9NRW7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms