Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX15Q9NRS6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX15Q9NRS6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms