Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO6Q9NRD1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO6Q9NRD1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms