Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BIN3Q9NQY0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BIN3Q9NQY0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms