Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DMRT3Q9NQL9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DMRT3Q9NQL9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DMRT3Q9NQL9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DMRT3Q9NQL9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms