Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC52A3Q9NQ40 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC52A3Q9NQ40 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms