Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms