Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC4Q9NPG8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZDHHC4Q9NPG8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC4Q9NPG8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC4Q9NPG8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC4Q9NPG8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC4Q9NPG8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC4Q9NPG8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC4Q9NPG8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC4Q9NPG8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC4Q9NPG8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC4Q9NPG8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC4Q9NPG8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC4Q9NPG8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC4Q9NPG8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC4Q9NPG8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms