Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMG20AQ9NP66 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMG20AQ9NP66 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms