Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC4CQ9HCJ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRC4CQ9HCJ2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms