Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOBEC3GQ9HC16 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBEC3GQ9HC16 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOBEC3GQ9HC16 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms