Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CLSPNQ9HAW4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CLSPNQ9HAW4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLSPNQ9HAW4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLSPNQ9HAW4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLSPNQ9HAW4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLSPNQ9HAW4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLSPNQ9HAW4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLSPNQ9HAW4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLSPNQ9HAW4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLSPNQ9HAW4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLSPNQ9HAW4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CLSPNQ9HAW4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CLSPNQ9HAW4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms