Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPCSQ9HAB8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PPCSQ9HAB8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms