Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1BQ9H9Y6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1BQ9H9Y6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR1BQ9H9Y6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR1BQ9H9Y6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1BQ9H9Y6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1BQ9H9Y6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1BQ9H9Y6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1BQ9H9Y6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1BQ9H9Y6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1BQ9H9Y6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1BQ9H9Y6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1BQ9H9Y6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1BQ9H9Y6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms