Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SUDS3Q9H7L9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUDS3Q9H7L9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms