Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
REEP4Q9H6H4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
REEP4Q9H6H4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms