Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S7

PTPN23, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN23Q9H3S7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PTPN23Q9H3S7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PTPN23Q9H3S7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTPN23Q9H3S7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms