Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP62CLQ9H1M0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP62CLQ9H1M0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP62CLQ9H1M0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms