Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG10Q9H0Y0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG10Q9H0Y0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG10Q9H0Y0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms