Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCOLN1Q9GZU1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCOLN1Q9GZU1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms