Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1EQ9GZS1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1EQ9GZS1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms