Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
REXO4Q9GZR2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO4Q9GZR2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms