Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YIPF3Q9GZM5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
YIPF3Q9GZM5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
YIPF3Q9GZM5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms