Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRCC1Q9C099 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.7 ms