Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM6Q9C030 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM6Q9C030 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms