Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM9Q9C026 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM9Q9C026 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM9Q9C026 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms