Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM31Q9BZY9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM31Q9BZY9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM31Q9BZY9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM31Q9BZY9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms