Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFIH1Q9BYX4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFIH1Q9BYX4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms