Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5DQ9BY66 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KDM5DQ9BY66 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
KDM5DQ9BY66 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
KDM5DQ9BY66 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms