Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C1QTNF4Q9BXJ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF4Q9BXJ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms