Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCRT1Q9BWW7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCRT1Q9BWW7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 427.9 ms