Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUSC1Q9BVN2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUSC1Q9BVN2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms