Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LIMD2Q9BT23 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LIMD2Q9BT23 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms