Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF1Q9BSM1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF1Q9BSM1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF1Q9BSM1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF1Q9BSM1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF1Q9BSM1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF1Q9BSM1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF1Q9BSM1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF1Q9BSM1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCGF1Q9BSM1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCGF1Q9BSM1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms