Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GINS3Q9BRX5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GINS3Q9BRX5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms