Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIKE1Q9BRV8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SIKE1Q9BRV8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms