Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PAAF1Q9BRP4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAAF1Q9BRP4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms