Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
BPIFA3Q9BQP9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BPIFA3Q9BQP9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms