Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM4BQ9BQ04 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms