Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PKP2Q99959 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PKP2Q99959 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms