Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD180Q99467 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD180Q99467 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD180Q99467 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD180Q99467 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD180Q99467 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD180Q99467 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD180Q99467 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD180Q99467 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD180Q99467 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD180Q99467 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD180Q99467 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD180Q99467 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD180Q99467 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD180Q99467 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD180Q99467 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD180Q99467 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD180Q99467 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD180Q99467 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD180Q99467 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD180Q99467 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD180Q99467 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD180Q99467 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD180Q99467 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD180Q99467 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD180Q99467 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD180Q99467 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD180Q99467 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD180Q99467 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD180Q99467 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD180Q99467 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD180Q99467 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD180Q99467 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD180Q99467 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD180Q99467 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD180Q99467 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD180Q99467 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD180Q99467 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD180Q99467 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD180Q99467 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD180Q99467 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD180Q99467 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD180Q99467 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD180Q99467 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD180Q99467 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD180Q99467 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD180Q99467 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD180Q99467 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD180Q99467 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD180Q99467 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD180Q99467 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD180Q99467 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD180Q99467 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD180Q99467 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD180Q99467 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD180Q99467 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD180Q99467 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD180Q99467 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD180Q99467 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD180Q99467 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD180Q99467 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD180Q99467 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD180Q99467 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD180Q99467 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD180Q99467 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD180Q99467 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD180Q99467 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD180Q99467 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 679.7 ms