Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCF12Q99081 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF12Q99081 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF12Q99081 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms