Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDRT15Q96T59 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDRT15Q96T59 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms