Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R9BQ96SB3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R9BQ96SB3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms