Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRAMP1Q96RY5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms